발전기금이 사용되는 용도는 곧 발전기금의 목적입니다. 뜻있는 성도들이 기부하여 조성된 발전기금은 다음의 5가지 목적으로 사용됩니다.

• 장학기금 : 우수한 인재를 발굴하고 교육하여 교회들의 미래를 이끌 역량 있는 일꾼을 키우기 위함입니다.
• 연구기금 : 역량 있는 교회의 영적 지도자를 키워내기 위해서 꼭 필요한 투자는 좋은 교수님을 청빙하는데 있습니다.
• 효율적인 교육환경 조성 : 원격으로 신학을 공부하는 데에 필요한 교구자재 및 스튜디오, 프로그램 개발은 급변하는 미디어의 기술에 부응하여 적응할 필요가 있습니다. 효과적인 학사관리시스템을 개발함으로 학생들은 가장 편안히 능률적인 학업을 할 수 있습니다.
• 장기적으로 한국사이버신학대학은 4년제 정규 신학대학이 될 계획을 가지고 있습니다. 이 목적을 이룰 기금을 단계별로  조성합니다.
• 끝으로 우리 대학을 졸업하고 대한예수교장로회 보수연합교단 소속 노회에서 목사로 임직한 분들 중에 국내외 교회개척을 지원할 계획이 있습니다.